Memasuki serialisasi ketiga mereka, duo manga Moritaka Mashiro dan Akito Takagi—juga dikenal dengan nama pena mereka, Muto Ashirogi—semakin dekat dengan impian mereka untuk membuat adaptasi anime. Namun, tantangan sebenarnya baru saja dimulai: jika mereka tidak mampu bersaing dengan artis Eiji Niizuma di peringkat dalam kurun waktu enam bulan, mereka akan dibatalkan. Terlebih lagi, banyak saingan yang berada di belakang dan menyatakan perang. Mereka bahkan tidak punya cukup waktu luang untuk memikirkan anime!
Di Bakuman. Musim ke-3, Muto Ashirogi harus menemukan cara untuk tetap berada di puncak gunung kolosal yang dikenal sebagai peringkat Shounen Jack. Dengan masalah baru dan asisten baru, pasangan ini terus berjuang mewujudkan impian mereka.
