Pada hari baru di wilayah Kanto, Satoshi diundang oleh Profesor Yukinari Ookido ke upacara pembukaan lab Profesor Sakuragi di Kota Vermillion. Selama pidato seremonial, Profesor Sakuragi menerima peringatan tentang kemungkinan munculnya Pokémon langka di pelabuhan Kota Vermillion, membuat Satoshi dan pelatih lainnya bergegas ke daerah tersebut dengan harapan menemukan Pokémon misterius tersebut. Di pelabuhan, mereka menemukan Lugia—a Pokémon Legendaris—terlibat dalam pertarungan dengan pelatih lain.
Memperhatikan pelatih lain & # 039; Taktiknya, Satoshi meminta rekannya, Pikachu, menyerang Lugia dengan serangan Thunderbolt. Tidak terpengaruh, Lugia melarikan diri, tetapi Satoshi dengan tegas melompat ke punggungnya. Yang mengejutkan Satoshi, dia bertemu anak laki-laki lain, Gou, yang juga melompat ke punggung Lugia. Keduanya menaiki punggung Lugia yang membawa mereka dalam petualangan aneh melintasi lautan. Saat keduanya kembali ke tanah, Satoshi dan Gou mengucapkan selamat tinggal pada Lugia dan kembali ke Institut Sakuragi.
Terkesan dengan temuan Gou dan wawasan Satoshi yang diambil selama pertemuan mereka, Sakuragi meminta keduanya menjadi mitra penelitian barunya. Maka perjalanan duo ini dimulai, melakukan perjalanan melintasi berbagai wilayah untuk bertemu banyak Pokémon—termasuk yang memiliki kemampuan Gigantamax!
